Le saviez-vous? Une étude génomique pourrait aider à guérir le diabète

Il s'agit de l'étude de tous les gènes aux niveaux de l'ADN, de l'ARNm et du protéome, ainsi qu'au niveau cellulaire ou tissulaire. ou simplement l'étude génomique peut aider à guérir le diabète de type 2.

Une nouvelle étude menée par des scientifiques de l'université de Harvard a indiqué que des modifications génétiques héréditaires pourraient être à l'origine de la variabilité observée chez les patients en clinique, plusieurs processus physiopathologiques pouvant conduire à une glycémie élevée et à ses conséquences.

En analysant les données génomiques à l'aide d'un outil informatique intégrant la complexité génétique, les chercheurs ont identifié cinq groupes distincts de sites d'ADN qui semblent conduire des formes distinctes de la maladie de façon unique.

Les travaux ont constitué le premier pas vers l'utilisation de la génétique pour identifier les sous-types du diabète de type 2, ce qui pourrait aider les médecins à prescrire des interventions visant la cause de la maladie plutôt que les symptômes.

«Lorsque nous traitons le diabète de type 2, nous pouvons utiliser une douzaine de médicaments, mais après avoir utilisé l’algorithme standard, c’est avant tout un essai et une erreur», a déclaré l’auteur principal Jose Florez. «Nous avons besoin d'une approche plus granulaire qui aborde les nombreux processus moléculaires menant à une glycémie élevée.»

On sait que le diabète de type 2 peut être globalement regroupé en cas d'incapacité des cellules bêta du pancréas à produire suffisamment d'insuline ou d'insuffisance d'insuline dans le foie, les muscles ou les tissus adipeux. , connue sous le nom de résistance à l'insuline.

Les recherches précédentes ont tenté de définir davantage de sous-types de diabète de type 2 sur la base d'indicateurs tels que la fonction des cellules bêta, la résistance à l'insuline ou l'indice de masse corporelle, mais ces caractéristiques peuvent varier considérablement au cours de la vie. Des différences génétiques héréditaires sont présentes à la naissance et une méthode plus fiable consisterait à créer des sous-types basés sur les variations de l'ADN associées au risque de diabète lors d'études génétiques à grande échelle. Ces variations peuvent être regroupées en grappes en fonction de leur impact sur les caractéristiques liées au diabète. Par exemple, les modifications génétiques liées à des taux élevés de triglycérides sont susceptibles de mener à bien les mêmes processus biologiques .

Efforts précoces pour y parvenir en utilisant une approche de «grappes rigides», dans laquelle chaque variation génétique était assignée à un seul cluster. Cependant, cela n'a pas réussi à produire des schémas ayant un sens biologique.

Les chercheurs ont ensuite appliqué une approche dite de «soft-clustering» connue sous le nom de factorisation de matrice bayésienne non négative, qui permet à chaque variante de se classer dans plusieurs groupes.

«La méthode de la classification en grappes est meilleure pour étudier les maladies complexes, dans lesquelles les sites génétiques liés à la maladie peuvent réguler non pas un seul gène ou processus, mais plusieurs», a déclaré Udler, chercheur.

Le nouveau travail a révélé cinq groupes de variants génétiques distingués par des processus cellulaires sous-jacents distincts, au sein des divisions majeures existantes de la maladie à insuline résistante et de insuline-defi. Deux de ces grappes contiennent des variantes qui suggèrent que les cellules bêta ne fonctionnent pas correctement, mais leurs effets sur les taux de précurseur d’insuline, la proinsuline, diffèrent. Les trois autres grappes contiennent des variants d'ADN liés à la résistance à l'insuline, y compris une grappe médiée par l'obésité, définie par le métabolisme perturbé des graisses dans le foie et par la lipodystrophie.

Pour confirmer ces observations, l'équipe a analysé des données pour la recherche sur la biologie et les maladies. Ils ont constaté que les gènes contenus dans les groupes étaient plus actifs dans les types de tissus auxquels on pouvait s'attendre.

Pour mieux vérifier si le mécanisme biologique approprié avait été attribué à chaque grappe, les chercheurs ont recueilli des données auprès de quatre cohortes indépendantes de patients atteints de diabète de type 2 et ont calculé les scores de risque génétique individuels des patients pour chaque grappe. Ils ont constaté que près d'un tiers des patients avaient obtenu un score élevé pour une seule grappe prédominante, ce qui suggère que leur diabète pourrait être dominé par un seul mécanisme biologique.

Lorsqu'ils ont ensuite analysé les mesures des traits liés au diabète chez des sujets ayant obtenu un score élevé, ils ont observé des schémas qui reflétaient fortement le mécanisme biologique suspecté et les distinguaient de tous les autres patients atteints de diabète de type 2. On a en effet constaté que les grappes à médiation médiane avaient un indice de masse corporelle et un pourcentage de graisse corporelle plus élevés.

Les résultats semblent refléter une partie de la diversité observée par les endocrinologues de la clinique. Par exemple, les personnes ayant un score élevé dans le groupe de type lipodystrophie étaient probablement plus minces que la moyenne mais présentaient un diabète insulino-résistant, semblable à un type rare de diabète dans lequel les graisses s'accumulent dans le foie. résistance résultant de l'obésité.

«Les grappes de notre étude semblent récapituler ce que nous observons dans la pratique clinique», a déclaré Florez. «Maintenant, nous devons déterminer si ces groupes se traduisent par des différences dans la progression de la maladie, les complications et la réponse au traitement.»

Source: ANI

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Publication: 23 septembre 2018 6h55 | Mis à jour: 23 septembre 2018 6h55

        
            
        
        

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